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隨著環保犯罪手法日益複雜、集團化，單一機關難以全面掌握不法行為，為了提升查緝效能、縮短應變時間，本署積極與司法、財稅、農政等部會攜手，透過「結盟執法」機制，共同打擊污染源頭，守護國土環境安全。

本署成立「臺中國土保育團隊」並長期攜手合作，透過資訊整合與智慧科技的導入，有效追蹤違法行為模式，強化辦案力道。團隊率先將資訊平臺導入環保犯罪查緝體系，讓團隊成員能即時掌握犯罪情資、防止證據湮滅，並善用智慧數據分析，掌握轄區棄置熱點與潛在風險區域。針對不同犯罪型態執行專案，直搗不法核心，查扣犯罪工具與不法所得，並要求行為人回復環境原狀。

針對非法廢棄物輸出問題，與財政部關務署臺中關合作啟動「邊境廢棄物輸出入聯防機制」，強化貨櫃查驗、風險評估與系統比對。112下半年起至113年間多次接獲疑似出口廢棄物案件通報，經深入研析後發現有多家互相關聯之公司，涉嫌以「塑膠原料」為名非法輸出廢塑膠混合物。本署中區中心聯合臺中地檢署與臺中市環保局執行搜索，共攔截56櫃非法廢塑膠混合物輸出，重達1,000公噸，同時要求業者清理倉儲堆置的3,000公噸廢棄物。

在跨機關合作與智慧科技導入的雙軌並進下，與各單位聯手查緝環保犯罪已有具體成果。為持續擴大成效，已向行政院提出「強化廢棄物流向遠端數位管理智慧決策計畫」，預計未來4年投入新臺幣23.5億元，布建2,200處e-Tag與車牌辨識點，整合AI辨識與GPS監控，建構全國「智慧圍籬」網絡。此外，也將持續強化跨機關聯防機制，全方位守護國土環境安全。